Bách Yêu Phổ Phần 2 tiếp nối hành trình đầy kỳ bí của linh y Đào Yêu cùng tiểu hòa thượng Ma Nha và Liễu công tử. Họ tiếp tục đồng hành cùng tiểu hồ yêu đã được thu phục ở phần trước để viết nên những chương mới đầy hấp dẫn.
Mục tiêu chính của cả nhóm là lên đường đi khắp bốn phương nhằm tìm kiếm cuốn Bách Yêu Phổ đã bị thất lạc. Trên chặng đường phiêu lưu đầy trắc trở, họ lần lượt gặp gỡ những yêu quái như Ưng Thanh, Hóa Xà, Âu Cơ và Chiếu Hải.
Thông qua việc tiếp xúc với những yêu quái này, nhóm của Đào Yêu đã nỗ lực chữa trị nhiều căn bệnh khó chữa cho chúng. Mỗi cuộc gặp gỡ không chỉ là một thử thách mà còn là cơ hội để họ khám phá những bí ẩn sâu xa phía sau các loài yêu quái.