Chinmoku no Kantai: Hokkyokukai Daikaisen tiếp nối hành trình đầy kịch tính của tàu ngầm hạt nhân Yamato sau trận chiến tại vịnh Tokyo. Dưới sự chỉ huy của thuyền trưởng Shirou Kaieda, con tàu không chỉ là một phương tiện quân sự mà còn trở thành biểu tượng gây tranh cãi gay gắt giữa hòa bình và nguy cơ xung đột toàn cầu.
Trong hành trình hướng tới New York, Yamato bất ngờ rơi vào tình thế hiểm nghèo khi đi qua khu vực eo biển Bering và Bắc Băng Dương. Tại đây, con tàu trở thành mục tiêu săn đuổi gắt gao của một tàu ngầm hạt nhân tối tân từ phía Mỹ.
Với mệnh lệnh tiêu diệt từ Tổng thống Mỹ, Yamato bị liệt vào danh sách mối đe dọa khủng bố hạt nhân nguy hiểm. Cuộc đối đầu nghẹt thở giữa hai chiến hạm trên đại dương lạnh giá hứa hẹn sẽ mang đến những giây phút hành động và chiến tranh đầy căng thẳng cho khán giả.