Hero's Island đưa khán giả trở về bối cảnh Okinawa thời hậu chiến, nơi tình bạn giữa Gusuku, On, Yamako và Rei từng gắn kết bền chặt. On, với tư cách là thủ lĩnh dũng cảm, đã dẫn dắt nhóm bạn đột nhập vào căn cứ quân sự Mỹ để lấy nhu yếu phẩm cứu giúp người dân địa phương, trở thành hình mẫu anh hùng trong mắt mọi người. Tuy nhiên, một chuyến đột nhập định mệnh đã khiến On mất tích đầy bí ẩn sau khi bị binh lính Mỹ truy đuổi, để lại khoảng trống không thể lấp đầy trong lòng những người ở lại.
Nhiều năm trôi qua, Gusuku trở thành cảnh sát, Yamako làm giáo viên tiểu học, còn Rei lại dấn thân vào con đường yakuza. Dù đã trưởng thành và có cuộc sống riêng, cả ba vẫn không thể nguôi ngoai nỗi ám ảnh về sự mất tích của người bạn năm xưa. Họ quyết định cùng nhau truy tìm sự thật đằng sau biến cố năm đó, dẫn đến việc phơi bày một câu trả lời đầy chấn động và bất ngờ.