Bộ phim Ký Sinh Thú mở ra câu chuyện đầy kịch tính khi những sinh vật ngoài hành tinh có hình dạng giống loài sâu bất ngờ đổ bộ xuống Trái Đất. Chúng xâm nhập vào cơ thể con người qua tai hoặc mũi để chiếm lấy não bộ và điều khiển vật chủ theo ý muốn.
Tại một khu phố yên tĩnh ở Tokyo, thiếu niên 17 tuổi tên Shinichi đã may mắn thoát khỏi sự kiểm soát của một ký sinh vật nhờ đeo tai nghe khi ngủ. Tuy nhiên, sinh vật này đã xâm nhập vào cánh tay phải của cậu và lấy tên là Migi, bắt đầu một cuộc sống cộng sinh đầy lạ lẫm giữa người và vật thể ngoài hành tinh.